Neue Kits und neuartige Arbeitsabläufe für die Plasma- und Serum-Proteomik von LC

Wir ermöglichen unseren Kunden in den Biowissenschaften, biologisches Wissen durch effiziente, zuverlässige Lösungen und Arbeitsabläufe zu etablieren, die den Standard für die Proteinanalyse setzen. Unser Teamgeist, unsere Energie und unser Engagement...

HOUSTON, TX – Auf der ASMS 2023 kündigt die PreOmics GmbH die Einführung ihrer neuen ENRICH-iST™-Kits an, die eine biologisch unvoreingenommene Anreicherung von weniger häufig vorkommenden Plasma- und Serumproteinen auf nicht funktionalisierten paramagnetischen Partikeln ermöglichen und so die typische Tiefe der Plasma-Proteomik-Analyse um das 50-fache erhöhen Prozent bis mehr als 100 Prozent im Vergleich zur reinen Plasma- oder Serumproteomik ohne Abreicherung oder Anreicherung. Der neuartige ENRICH-iST-Workflow ermöglicht eine schnelle und robuste Verarbeitung von bis zu 96 Plasmaproben parallel für reproduzierbare translationale und klinische Forschung und Validierung großer Kohorten. Der kostengünstige ENRICH-iST-Routineanreicherungsworkflow ergänzt hervorragend bestehende Forschungsworkflows zur Entdeckung von Ultra-Deep-Plasma-Proteomics, die entweder eine automatisierte Perlenabreicherung oder eine Nanopartikel-Array-Anreicherung nutzen.

Die ENRICH-iST-Technologie bietet eine einfache, schnelle (insgesamt <5 Stunden) und kostengünstige Lösung für die proteomische Probenverarbeitung von Plasma oder Serum verschiedener Arten, darunter Menschen, Nagetiere, NHPs, Hunde und Schweine. Es benötigt nur 20 Mikroliter Ausgangsmaterial und liefert durchgängig reproduzierbare, verbesserte Ergebnisse für die LC-MS-Analyse, z. B. durch DIA-PASEF timsTOF 4D Proteomics-Massenspektrometrie. Durch die Verwendung nicht funktionalisierter paramagnetischer Mikrokügelchen ermöglicht die Technologie eine biologisch neutrale Anreicherung von weniger häufig vorkommenden Proteinen und unterstützt Automatisierungsplattformen für die Handhabung von Flüssigkeiten wie Tecan FLUENT-Systeme.

Dr. Andreas-David Brunner, Drug Discovery Sciences, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, erklärt: „Wir arbeiten routinemäßig mit Bioflüssigkeitskohorten, die aus präklinischen Spezies stammen. Die neuartige ENRICH-Technologie von PreOmics ermöglichte uns eine zuverlässige und detaillierte Proteomik.“ Daten ohne aufwändige Methodenentwicklung. Das neue Kit funktionierte sofort, der Arbeitsablauf ist intuitiv und kann vollständig automatisiert werden. Diese Lösung ermöglicht uns eine vollständige Standardisierung unserer Prozesse und verbessert unseren Durchsatz erheblich.“

In einer Benchmark-Studie wurden Plasma- und Serumproben von Menschen-, Maus- und Rattenproben (von den Lieferanten Sigma Aldrich, BioIVT und Diaserve Laboratories GmbH) mit dem neuartigen ENRICH-iST-Workflow im Vergleich zur Antikörper-basierten Depletion verarbeitet bis hin zu unverarbeiteten Reinproben. Die Peptide wurden auf einem timsTOF HT-Massenspektrometer (Bruker Daltonics) im DIA-PASEF-Modus unter Verwendung eines 30-minütigen nanoLC-Gradienten analysiert. Es wurde gezeigt, dass der ENRICH-iST-Workflow die proteomische Tiefe von Peptiden und Proteinen im Vergleich zu reinen Proben um das 1,5- bis 2,2-fache erhöht. Typische Variationskoeffizienten (CV) innerhalb der Replikate lagen unter 12 Prozent, was die hohe Wiederholbarkeit des ENRICH-iST-Workflows unterstreicht. Der Abgleich der identifizierten Proteine ​​mit der Plasma-Proteom-Datenbank ergab eine bessere Abdeckung für den ENRICH-iST-Workflow gegenüber reinen und abgereicherten Proben, wobei die identifizierten Proteine ​​einen größeren dynamischen Bereich abdecken. ENRICH-iST zeigte im Vergleich zum Depletion-Workflow eine höhere Präzision über den gemessenen Häufigkeitsbereich.

Dr. Catherine Nury, Manager Proteomics, Philip Morris International, Schweiz, kommentiert: „Wir haben mehrere Optionen für die Entdeckung von Biomarkern an Plasmaproben getestet, aber viele waren langwierig und mühsam. Mit der neuartigen ENRICH-Technologie verfügen wir über eine schnelle, effiziente und zuverlässige Lösung.“ Anreicherungsworkflow, um tiefer in das Proteom aus menschlichem Plasma und Serum einzudringen. Wir verwenden die ENRICH-iST 96x-Kits und sind von der Reproduzierbarkeit und Benutzerfreundlichkeit des Kits begeistert. Die Zusammenarbeit mit dem PreOmics-Team hat uns sehr viel Spaß gemacht, die uns immer zur Seite stehen . Wir würden das Kit anderen Anwendern von Plasma- und Serum-Proteomik wärmstens empfehlen.“

Automatisierung ist der Schlüssel für die Hochdurchsatz-Plasmaproteomik und Luca Valeggia, Senior Vice President – ​​Lab Automation bei Tecan, fügt hinzu: „Wir freuen uns, unsere Zusammenarbeit mit PreOmics fortzusetzen. Durch die Automatisierung ihres neuen ENRICH-iST-Kits auf unserer Fluent-Workstation können wir „ermöglichen eine robuste und reproduzierbare Hochdurchsatz-Probenvorbereitung für große Kohortenstudien und tragen dazu bei, den Fortschritt in diesem schnell voranschreitenden Bereich weiter zu beschleunigen.“